On Friday(June 19th, 2020) , I started building my Petri Dishes.

금요일에 제가 페트리 접시에 박테리아가 자랄 아가(한천) 젤을 담았어요.

Another problem occurs here! I was first supposed to build my LB Agar Petri Plates, but I accidentally mistakened LB Strep/Kan/Arabinose Agar as LB Agar, and built my first 7 Petri dishes with LB Strep/Kan/Arabinose Agar.

여기서 또 큰 문제가 발생하죠^^ 원래 LB Agar라는 가루를 붓고, 물을 부은 다음, 전자레인지에 녹여서 페트리 접시에 붓는 거였는데 실험 거의 끝날 때쯤 사용할 LB Strep/Kan/Arabinose Agar를 대신 녹였네요^^ 그리고, 이 LB Strep/Kan/Arabinose Agar이랑 물을 유리병에 담아, 흔들어준 후 전자레인지에 짧게, 여러번 돌리고, 잠시 전자레인지에서 빼서 흔들어줘야 되는데 저는 그것도 모르고 계속 돌렸어요^^

While I was microwaving my LB Strep/Kan/Arabinose Agar, I thought it was okay for the solution to be clear yellow, with this white precipitate sinking on the bottom of the glass bottle, and continued on with microwaving. I DID NOT clearly let the glass cool down for a few seconds, shake the bottle again, and microwave it, but instead continued microwaving.

돌리다 보니, 원래 완전히 투명한 노란 액체여야 되지만, 투명한 노란 액체에 유리병 밑에 이상한 흰색 가루가 아직 있더라고요. 저는 이게 정상인줄 알고, 페트리 접시에 부었어요.

When I opened the microwave, grey smoke came out of the microwave and this burnt odor filled the entire kitchen. I poured the unmelted precipitate into my Petri dishes, and they resulted as liquid form even a few hours later. I realized, the agar had not completely melted, which resulted in an imbalance of the concentration of the agar. The Petri dishes with the high concentration of Agar also had spotty solidified areas with liquid around it.

다 녹인줄 알고 전자레인지를 열었더니, 눈이 매우면서 검은색에 가까운 진회색 연기가 엄청 나오고 이상한 매연 비슷한 탄내가 아주 주방을 채웠어요. 이 흰색 가루가 다 녹아야 되지만, 저는 그걸 모르고 페트리 접시에 부으다 보니, 몇시간이 흘러 확인해볼 때 원래 굳어야 되는 아가겔이 안 굳고 아직 액체 형태였어요. 아가겔 가루가 있는 페트리 접시는 그 가루가 있는 곳에만 굳고, 그 주변에는 다 액체였어요.

I had a weird gut feeling, and so I reread the instruction manual, and oh boy.. I realized I had microwaved the WRONG solution first. But luckily, the process of the LB Agar was the exact same with the LB Strep/Kan/Arabinose Agar solution, so I was able to reflect on my previous mistakes with the LB Strep/Kan/Arabinose Agar. I poured the powder in, added 150 mL of water, and shook vigorously, like the instruction manual stated.

LB Strep/Kan/Arabinose Agar를 페트리 접시에 붓고 굳을 때까지 기다리고 있었는데, 뭔가 미세하게 기분이 찝찝하고 불안했어요.. 그래서 다시 확인하려고 사용 설명서를 읽었더니 속으로 욕했어요.. 하.. 망했구나.. 원래 LB Agar를 먼저 전자레인지에 돌려서 LB Agar에서 박테리아를 키운 다음, CRISPR 액체랑 섞어서 LB Strep/Kan/Arabinose Agar에 바르는 걸로 진행이 되야되는데 저는 그 반대로 했지 뭐에요^^ 그래도, 다행이였던게 LB Agar를 만드는 방법이 LB Strep/Kan/Arabinose Agar랑 똑같았어요. 그래서 LB Strep/Kan/Arabinose Agar녹이면서 겪었던 실수랑 실패를 다시 되돌아보고 LB Agar를 녹일 때에는 실수하지 말자!라는 긍정적으로 생각하려고 했어요. LB Agar 만들 때 혹시 다시 실수할 수 있으니 사용 설명서에 써있는 그대로 다시 150mL의 물을 유리병에 붓고 LB Agar 가루를 부어준 다음, 유리병을 닫고 힘차게 흔들어줬어요. 팔 빠지는 줄 알았어요..

I changed my method of microwaving the Agar solution this time by instead of just stopping the microwaving and waiting for 1~2 seconds, I stopped the microwave, took the bottle out and shook the bottle in circular motions(GENTLY) so that the clear solution wouldn’t evaporate as much from leaving the bottle in the microwave for another minute, and also so that the powder would actually dissolve.

LB Agar를 녹이는 방법을 조금 수정했어요. 유리병을 전자레인지에 30초 간격으로 돌리지 않고, 5초 간격으로 전자레인지에 돌렸다가, 유리병을 빼서 원을 그리듯이 살살 돌려주었어요. 이렇게 해야 아가가 녹아있지 않은 투명한 액체의 수분만 증발 안하게끔 했어요. 그 방법을 계속 반복했더니, 가루가 다 녹았어요.

My newly revised plan was a success! The powder actually dissolved in the water, and there was a drastic decrease in the smoke from the microwave along with no smoky odor.

방법을 고쳐봤더니 대성공이였어요! 가루가 다 녹았고, 전자레인지에서도 연기가 안 나고, 탄내도 없었어요!!

As you can see in the picture above, when I poured in the LB Agar solution onto the Petri dishes, the solution was all evenly dissolved, and after leaving it to harden for 3~4 hours, I checked the Petri dishes. The LB Agar solution actually hardened!

사진에서 보다시피, LB Agar를 녹인 액체를 페트리 접시에 부었을 때, 가루가 다~~ 녹아서 뭉친 가루 덩어리도 없었어요. 그리고, 성공적으로 액체가 드디어 굳었어요.

Since I microwaved the LB agar solution AFTER the LB Strep/Kan/Arabinose Agar solution, I checked the LB Strep/Kan/Arabinose Agar-filled Petri dishes while I was checking my LB Agar Petri dishes, and the liquid was still in the same form. I did a brief research on the internet, and I found out that scientists reuse Agar gel? And that I was able to microwave and reheat the Agar, despite the concentration of the Agar being more concentrated..?

LB Agar 녹이기 전에 이미 LB Strep/Kan/Arabinose Agar를 녹여서 LB Agar 페트리 접시가 다 굳었나? 확인할 때 LB Strep/Kan/Arabinose Agar페트리 접시도 같이 확인했어요. 그러나, LB Strep/Kan/Arabinose Agar는 굳지 않고 똑같은 형태였어요(덩어리진 액체). 잠시 인터넷에서 찾아봤는데 과학자들이 아가 겔을 자주 녹여서 재사용한다는 기사를 많이 봐서 망한 LB Strep/Kan/Arabinose Agar를 다시 유리병에 부어서 녹이기로 결정했어요. 하지만, 액체를 유리병에 부으면서 옆으로 많이 쏟았어요….

I knew that this would cause inaccurate results, but I thought this would be better than not being able to even experiment because my LB Strep/Kan/Arabinose Agar would not harden.. So I poured all the LB Strep/Kan/Arabinose Agar solutions back into the glass bottle, shook extremely vigorously to break the hard, concentrated parts, and put the glass bottle into the microwave. I microwaved the bottle for 5 seconds, took the bottle out and shook it, then put it back into the microwave and microwaved for another 5 seconds. I repeated this process until the solution was nearly all clear. However, I failed to completely dissolve all the concentrated clumps in the LB Strep/Kan/Arabinose Agar solution, so when I checked the newly-poured in Petri dishes containing LB Strep/Kan/Arabinose Agar, there were tiny clumps of LB Strep/Kan/Arabinose Agar in random parts of the Petri dishes..

물론, 다시 유리병에 부어서 전자레인지에 돌리면, 가루:물 비율에 가루 농축?이 더 진하겠죠. 그렇지만, 실험을 아예 못하는 것보다 조금 증발하고 농축된 LB Strep/Kan/Arabinose Agar로 실험을 계속하는 것이 더 나을 수 있다라는 생각으로 유리병에 LB Strep/Kan/Arabinose Agar액체를 다시 부어서 전자레인지에 부었어요. LB Strep/Kan/Arabinose Agar액체가 워낙에 제대로 안 녹아서 가루 덩어리진 부분들만 딱딱하게 굳었어요. 그래서 유리병을 열심히 흔들고 전자레인지에 돌려도 덩어리는 작아졌지만, 그래도 있더라고요ㅜㅜ 그래서 LB Strep/Kan/Arabinose Agar 페트리 접시에는 아가겔 안에 작은 덩어리들이 있어요..

I faced another problem during my microwaving process for BOTH the LB Strep/Kan/Arabinose Agar and LB Agar solutions. I was unaware that the liquid boiled over the bottle, and eventually I lost a LOT of the solutions from overboiling the solutions. This may have been due to the lamp in my microwave. The microwave I used had the lamp button that only turned the lamp on for 2~3 seconds. And thus, I was unable to see that the Agar solutions were bubbling furiously. I also spilt a lot of the agar powder and water while pouring them into the glass bottle. I should have used a funnel..

LB Agar랑 LB Strep/Kan/Arabinose Agar액체를 녹이면서 또 아주 큰 실수를 저질렀어요. 물론, 짧은 간격으로 전자레인지에 유리병을 돌렸지만, 전자파에 대해서 걱정한다고 유리병을 제대로 안 지켜봤어요. 추가적으로, 전자레인지 안에 볼 수 있게끔 설치되있는 램프도 키면 2~3초 동안만 빛을 비춰서 오랫동안 못 지켜봤어요. 그래서 유리병 안에 있는 액체가 부글부글 끓는다는 것을 저는 모르고 계속 전자레인지에 돌리다가 유리병을 꺼내려고 전자레인지를 열었더니 전자레인지 바닥에 아가 액체가 좀 많이 흘러나왔어요.. 이 실수 말고도 아가 가루랑 물을 유리병에 부을때 깔때기를 썼었어야 했는데, 저는 에이, 단순 작업인데 뭔 깔때기야? 라는 헛된 자신감으로 그냥 부었어요.. 역시나, 유리병 옆으로 가루랑 물도 많이 흘러서 실험 결과는 부정확할 것 같아요..

I, then, closed the lids on the Petri dishes and flipped the dishes upside down so that the open side of the bottom Petri dish would face the ground(lid on the ground). I did this so that the condensation formed from the warm Agar solutions would not drop onto the hardened Agar gel.

제가, 아가 액체들을 다 페트리 접시에 부은 다음, 모든 페트리 접시들을 거꾸로 뒤집었어요. (뚜껑이 땅에 있게끔) 거꾸로 뒤집었던 이유가 따뜻한 아가 액체를 페트리 접시에 붓고 바로 뚜껑을 껴서 뜨거운 액체에서 나오는 온갖 김과 응축이 모이면서 김에서 생긴 물방울이 굳은 아가겔에 안 떨어지게끔 할려고 했어요.

HOWEVER, the next day(Saturday), I walk over to the room of the experiment being held in, and I was filled with shock at the sight of the Petri dishes of the LB Strep/Kan/Arabinose Agar mixed with the Petri dishes of the LB Agar. I had used a foil/bubble wrap as the “mat” for my experiment because I did not want to contaminate the house floor.. I forgot to close the door of the room, and my dog had ran over the mat over night and flipped the mat over with her nose. Luckily, since I had flipped all the Petri dishes upside down the night before, I was able to easily identify which dishes were the LB Strep/Kan/Arabinose Agar, and which were the LB Agar. The dishes that had the lid facing downward were the LB Strep/Kan/Arabinose Agar, and the dishes with the lid facing upward were the LB Agar. I really should have been cautious about my dog, and I wish I could’ve chosen a higher place where my dog was unable to reach.. I also should have closed the door.

그러나, 그 다음날에(토요일), 아주 큰 사건이 일어납니다. 엄마의 허겁지겁 충격적인 부름을 듣고 저는 번쩍 일어나 실험했던 방으로 뛰어갑니다. 페트리 접시들을 밑에 받칠려고 호일 버블랩 같은 비닐을 밑에 깔았는데, 제가 잠잔다고 그 방문 닫는 것을 까먹어서 열어놓고 잤어요.. 강아지가 새벽에 그 방에 들어가서 비닐을 코로 쑤셔서 LB Strep/Kan/Arabinose Agar 담은 페트리 접시가 LB Agar 접시랑 막 섞였어요. 그렇지만, 전날밤 다 뒤집어 놓았기 때문에 뚜껑이 위에 있는 접시가 LB Strep/Kan/Arabinose Agar인 것을 확신했어요.

WARNING FOR NEW BEGINNERS(이 실험을 할 초보들에게 경고!!)

PLEASE use a microwave where you can turn the lamp on for a long time, or please, at least, watch your bottle with extreme caution and care.

램프가 오랫동안 켜지는 전자레인지를 사용하는 것을 추천합니다. 그런 전자레인지를 못 찾으면 전자레인지의 창문 같은 유리로 통해서 섬세하게 관찰해주세요..

PLEASE be equipped with a funnel for more accurate results. I was super arrogant and had too much self confidence that I wouldn’t spill the powder and water while pouring them into the glass bottle, but please purposely doubt your abilities for the better..

아가 가루랑 물 부을때 깔때기를 꼬오오옥 준비하세요!! 깔때기 쓰면 훨씬 더 정확하게 실험 결과가 나올거에요. 저는 헛된 자신감으로 깔때기를 안 썼는데 많이 후회스럽네요..

For people who are interested in trying this kit, PLEASE repeat this process while microwaving your Agar solution:

이 키트를 체험하고 싶은 분들은 아가 액체 녹일 때 제발 이 방법을 따라하세요…

1. Gently place the lid on the bottle, but do NOT screw the cap on.
2. Microwave your bottle for 5~10 seconds.
3. Open the microwave, take the bottle out, and gently swirl the bottle in circular motions for another 5~10 seconds.

1. 전자레인지에 넣을 때 유리병의 뚜껑을 살포시 얹고, 뚜껑을 돌리고 잠그지는 마세요..
2. 전자레인지를 5~10초동안만 돌려주세요..
3. 전자레인지를 열고, 유리병을 꺼내고, 원을 그리듯이 살살 유리병을 5~10초 돌려주세요.

Repeat this process until the white Agar powder on the bottom of the glass is fully dissolved and the liquid is transparent(or very slightly translucent)

흰색 아가 가루가 다 녹고 유리병에 들어있는 액체가 다 투명할 (아주 살짝 반투명이여도 괜찮음) 때까지 이 방법을 계속 반복하세요..

-Joanna Kim, June 22, 2020, 1:09AM KST